能源相關議題一直是產官學各界持續關注的焦點，近年來尤其是燃料電池技術的發展，在各個應用範疇皆投入龐大的研發能量，由於若干關鍵技術的突破，其商業價值也已具體成形。本系自2003年起投入燃料電池相關研究，經由產學合作開始從事低溫型燃料電池的研究開發與應用，2006年在教育部重點特色專案計畫補助下，成立燃料電池實驗室，多年來持續努力，建構完整的低溫型燃料電池研究教學設備，執行政府單位以及產學研界的研究計畫，同時也致力於能源技術教學以及氫能教育推廣。

本實驗室著重於低溫型燃料電池(DMFC、PEMFC)技術之研發與教學，重點包括：(1) 燃料電池特性量測與分析—過電位分析、交流組抗頻譜分析、效率評估、耐久性測試等；(2) 能量管理技術—多電源供應系統、燃料電池電能管理、機電整合應用；(3)燃料電池系統整合技術—燃料電池模型、燃料電池性能最佳化設計、燃料電池系統調控演算法、甲醇濃度偵測與管理、水熱管理技術；(4)製氫儲氫技術—儲氫材料製備與測試、重組製氫技術、多能源混成製氫；(5)氫能推廣教育—自行開發燃料電池教學平台，結合燃料電池組裝、測試、以及資料擷取和儀器控制等相關內容，進行燃料電池系統整合技術之教學與氫能教育推廣活動。